MOCAK dysponuje unikatową pracownią konserwacji sztuki współczesnej. Konserwacja dzieł z Kolekcji koncentruje się na ich zabezpieczaniu i zapewnieniu im odpowiednich warunków ekspozycji oraz magazynowania. Przede wszystkim jednak gromadzimy wszelkie informacje dotyczące warsztatu i sposobu pracy artystów, doboru materiałów i mediów oraz stosunku samych twórców do procesów starzenia się i degradacji ich prac. Na podstawie tych informacji ustalamy zakres dopuszczalnych zabiegów konserwatorskich. Wobec różnorodności współczesnej sztuki (od dzieł wykorzystujących zróżnicowane materiały i nowatorskie sposoby ich łączenia, poprzez formy niematerialne, o ograniczonej trwałości lub nietrwałe, po formy wyrazu artystycznego pozbawione w ogóle materialnej podstawy) konserwacja dzisiejszej sztuki nabiera zupełnie innego znaczenia niż w przeszłości.